In realtà JavaScript e Java sono due linguaggi completamente differenti(anche se il nome trae in inganno), e non penso proprio c'entrerà Java con Hytale.
E non penso farebbero altri linguaggi per lo scripting, io almeno penso che il JavaScript basti ed avanzi, semmai quando sarà possibile useranno WebAssembly(https://webassembly.org/), abbastanza comodo per "compilare" linguaggi nativi(C++, Rust, Dart, ecc.) in JavaScript, così magari da far moddare anche chi non conosce il JavaScript, ma la penso abbastanza improbabile come scelta